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深圳大学-竞价结果详情(CB105902017002182)

来自:采招网(www.bidcenter.com.cn) 大学 深圳

所属地区 广东省-深圳市 发布时间 2017/12/13 关键词大学深圳   近期更新6075项目点击关注“大学,深圳”实时招标项目

项目招标进展

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基本信息:
申购单主题:120例花生组织转录组测序
申购单类型:竞价类
设备类别:其他
使用币种:人民币
竞价开始时间:2017-12-13 14:11
竞价结束时间:2017-12-20 10:00 竞价已结束
申购备注:验收合格后,一个月后付全款。
申购设备详情:

|中 国采招网(bidcenter.com.cn)

中标供应商设备名称数量品牌型号售后服务规格配置中标单价中标理由
广州基迪奥生物科技有限公司120例花生组织转录组测序1按行业标准提供服务;测序服务达到以下要求:1.文库合乎上机要求;2.数据产出:转录组测序量不低于6G clean data,Q30>83%(Hiseq 4000 150PE);3.提供技术团队一对一的解答项目疑问4.提供个性化的分析服务,绘制针对该项目的文章图表,辅助文章产出,回复编辑意见。1. 技术目标:利用Illumina Hiseq4000 V6测序平台完成RNA转录组建库测序分析,测序策略为150PE,,测序量不低于6G clean data。数据质量值均需Q30>83%。2.技术内容:2.1完成120例植物样本的转录组文库构建:采用带有Oligo(dT)的磁珠富集真核生物mRNA,构建转录组文库,并采用AB公司的step ONE plus QPCR仪进行文库质检,当文库检测为单峰,且浓度高于3nM,体积大于25ul则判定为合格。并按照Illumina标准Cluster生成,pooling和定量方法进行样本文库混合,并制备Cluster。2.2完成120例植物样本的转录组测序:采用Illumina Hiseq 4000,PE150策略,数据量不低于6G clean data,数据质量值Q30>83%。2.3完成120例植物样本的转录组分析2.3.1 测序质量评估与原始数据过滤,去除接头序列及低质量reads2.3.2比对参考基因组或参考基因序列2.3.3测序与比对评估(数据比对统计,测序饱和度分析,测序随机性分析)2.3.4基因表达统计(基因覆盖度,表达量,表达量丰度分布)2.3.5新基因的转录本预测及注释2.3.6样本关系分析(主成分分析(PCA)、相关性检验、样本聚类图)2.3.7差异表达基因分析及筛选2.3.8差异基因散点图与火山图2.3.9差异基因表达模式聚类分析及绘制差异基因散点图2.3.10差异基因GO功能显著性富集分析2.3.11差异基因Pathway显著性富集分析2.3.12 SNP分析2.3.13基因结构优化2.3.14 基因可变剪切鉴定3 周期 样品检测合格次日起计算,在45个工作日内完成建库测序分析工作 4.交付地点:深圳大学5.交付形式:生成网页版的结果报告,数据上传百度云盘,进行线上传输.162000.0总价最低原则
联系方式:400-838-0606

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